docs: record incomplete knowledge worktree retirement

.project-docs/30-worklog/tasks/20260912-merge-kb-embedding-49e2b6c.md

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 - Worktree: D:\Datas\OthersProjects\makelore
 - Base commit: a0b869a333b12d28bfd96dcd89e8bc03ad47647d
 - Owner: codex
-- Status: Ready for Integration
+- Status: Blocked
 
 ## Scope
 
-- 将知识库向量模型配置提示与目录刷新修复源 `3507f70e114be94913c72aa9e70eb6f9455cd86d` 合入本地 main，更新集成状态；不包含其他分支、打包、推送、部署或工作树清理。
+- 将知识库向量模型配置提示与目录刷新修复源 `3507f70e114be94913c72aa9e70eb6f9455cd86d` 合入本地 main，更新集成状态；用户随后明确确认清理本次源工作树及忽略的依赖/构建输出，保留其分支和提交。不包含其他分支、打包、推送或部署。
 
 ## Intent And Constraints
 
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 - main 从 `a0b869a` 无冲突快进到修复源 `3507f70e114be94913c72aa9e70eb6f9455cd86d`；产品代码未经合并改写。
 - 知识库创建区现在明确展示加载、获取失败及未配置模型状态，提供管理员配置说明和刷新入口；刷新保留名称，未确认创建继续使用原请求身份。
 - 接受源任务的 current-state 提升候选，记录平台模型配置责任和客户端状态/刷新语义，不新增后端协议或产品方向决定。
+- 用户批准后的 bundled retire 部分失败：Git 报 Directory not empty，源目录仍存在，但 .git 文件与 Git worktree 登记已移除。源分支仍指向 `3507f70e114be94913c72aa9e70eb6f9455cd86d`；残留任务登记尚未清除，清理未完成，合并不受影响。
 
 ## Verification
 
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 ## Follow-ups
 
 - 安装版需后续重新打包/安装才能使用新增提示与刷新；仍需管理员核对 Yuxi 向量模型定义/维度及 Works Square 激活模型，线上具体配置缺口未验证。
-- 合并交付后单独询问是否清理本次源工作树。此前旧桌面工作树的残留目录及清理拒绝不属于本次移交/合并范围，未重试删除。
+- 用户已确认清理源任务 `20260912-kb-embedding-ml-6f8a21dc` 的工作树 `D:\Datas\OthersProjects\.codex-worktrees\makelore\20260912-kb-embedding-ml-6f8a21dc`。执行前已复核干净、managed、ready 状态及最新源提交在 main 内；同任务 resume 的 Concurrent/Planning Gates Passed，所有 peer 登记未变。bundled retire 失败后，已询问仅针对本目录及残留登记的一次人工恢复例外，等待明确答复。此前旧桌面工作树的残留目录及清理拒绝不属于本次范围，未重试删除。
 
 ## Promotion Candidates