Polish project documentation and runtime config

docs/kg-redesign/implementation_plan.md

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 已完成：
 
-- 从 `/Users/xuexue/new` 复制到 `/Users/xuexue/new2`。
+- 从 `原 new 目录` 复制到 `项目根目录`。
 - 排除 `node_modules`、`.env`、`data`、`__pycache__`、运行产物。
 - 将空间汇报材料和基准测试材料纳入 `docs/reports`。